2026-143-3

Srovnání programů pro identifikaci repetitivních elementů

Vedoucí práce: Mgr. Jan Pačes, Ph.D.

Konzultant: Ing. Marharyta Klianitskaya

Podstata a cíl práce

Repetitivní elementy, zejména transpozóny, tvoří podstatnou část genomů obratlovců. Existuje sice několik přístupů k jejich identifikaci a anotaci, ale výsledek je hodně závislý na konkrétním analyzovaném genomu.

Náplň činnosti studenta

Student porovná efektivitu a rychlost jednotlivých programů pro anotaci repetitivních elementů.

Doplňující informace

Místo řešení: Ústav informatiky a chemie (143)

Téma je možné zvolit pro následující specializace