2026-143-7

Dynamicky řiditelný kombinatorický generátor chemických struktur

Vedoucí práce: Ing. Ivan Čmelo, Ph.D.

Konzultant: -

Podstata a cíl práce

Enumerace dostupných chemických struktur z dané množiny stavebních bloků spojované na základě dané množiny reakcí je cenným nástrojem při tvorbě chemických katalogů (např. Enamine REAL) a virtuálních chemických knihoven k další analýze. Cílem práce je implementovat minimalistickou variantu takového generátoru, s možností průběžného promítání zpětné vazby na výběr reakcí a stavebních bloků, aby mohl uživatel nebo připojený model provádět průběžné korekce generovaných struktur.

Náplň činnosti studenta

Student se seznámí se stávajícími postupy pro kombinatorickou generaci chemických struktur a s jejich dostupnými implementacemi. Student navrhne vhodné řešení s minimem programovacích závislostí, implementuje jej jako skript popř. knihovnu v jazyce Python a otestuje jej v tandemu s vybraným modelem (QSAR/QSPR) poskytujícím průběžnou zpětnou vazbu.

Doplňující informace

Místo řešení: Ústav informatiky a chemie (143)

Téma je možné zvolit pro následující specializace