2027-143-8

Metaanalýza dat z luciferázových pokusů s vysokou propustností

Vedoucí práce: Milan Voršilák

Konzultant: Ctibor Škuta

Podstata a cíl práce

Luciferázy jsou jedním z nástrojů užívaných při testování s vysokou propustností. Jejich výhodou je nízké pozadí při měření. Naopak nevýhodou je jejich ovlivnitelnost chemickými látkami. V současné době je k dispozici velké množství dat z pokusů s jejich využitím a je možné analyzovat látky, které s nimi interagují. Tyto látky způsobují falešně pozitivitivní nebo negativní výsledky a bylo by vhodné se jim v tomto typu experimentů vyhnout.

Náplň činnosti studenta

Student ve veřejných databázích (ChEMBL, ECBD) vyhledá vhodná vstupní data. Jejich rozborem identifikuje problematické látky, které mohou zhášet nebo zesilovat signál luciferáz. Vhodnou analýzou těchto látek získá obecné informace, jaké vlastnosti mohou způsobovat problematické chování.

Doplňující informace

Místo řešení: Ústav informatiky a chemie (143)

Téma je možné zvolit pro následující specializace