Počítačová chemie (B403011)

Evropský sociální fond „Praha & EU: Investujeme do vaší budoucnosti“

Inovace předmětu Počítačová chemie je podporována projektem CHEMnote (Inovace bakalářského studijního programu Chemie – moderní vzdělávání podpořené použitím notebooků – CZ.2.17/3.1.00/33248) v rámci Operačního programu PRAHA – ADAPTABILITA.

Pravidla získání zkoušky

Následující informace se pro ZS 2024/5 změnily, za neaktuální informace na této stránce před 15.12.2024 se omlouvám.

Napsat písemný test (50 minut) na aspoň 50 %. Test obsahuje otázky (zpravidla s výběrem a), b), c)), výpočet na téma přípravy systému k simulaci a příklad na orientaci ve výstupu z programu Gaussian vč. jednoduchých výpočtů. První test se zpravidla píše poslední týden semestru.
Na tento test se přihlásíte pomocí SISu jako na zkoušku.
Zpracovat a obhájit projekt. Projekt, který budete řešit, si zapíšete pomocí sdíleného Google Sheet souboru, odkaz z bezpečnostních důvodů dostanete e-mailem. Tam se také přihlásíte na obhajobu a její formu (oral/poster). Zkontrolujte prosím, zda si nezapisujete projekt, který si už někdo vybral. Můžete si také vybrat projekt a zatím nevybírat datum.

Materiály

Příručka Teoretické chemie (Šištík, Ončák, Slavíček)
Knihovna vstupních souborů pro Gaussian (Šištík, Ončák, Slavíček)
První víkend s linuxem (Michal H. Kolář) – užitečné, budete‑li svůj projekt zpracovávat na výpočetním klastru
SIMOLANT (výukový program pro MD a MC simulace)
Skripta k předmětu Molekulové modelování a simulace (pouze vybrané části):
tisk oboustranně / na obrazovku
Ukázka vypracovaného protokolu (Ivana Jurásková)
Jak na protokol a prezentaci
Původní odkaz na MS Streams kanál – viz odkazy v posledním sloupci níže (čekají na migraci)
E-learning není aktuální

Přednášky

#	přednáška	tisk	videa přednášek \| errata
Q1	Kvantová chemie 1 (Petr Slavíček)		Úvodní slovo Cvičení – Gaussian
Q2	Kvantová chemie 2		Úvodní slovo Cvičení
Q3	Kvantová chemie 3		Úvodní slovo Korelační energie, báze
Q4	Kvantová chemie 4		Vibrační spektroskopie Transitní stavy Termodynamické veličiny Reakce v roztoku Excitované stavy
S1	Molekulární modelování a simulace (Jiří Kolafa)	1:10	Úvod, silové pole, výpočty
S2	MD, MC, analýza výsledků simulací - – — − ve Wordu	1:10	1: MD, MC 2: struktura, počítačový experiment 3: odhad statistických chyb Pokus: difrakce pomocí laserového ukazovátka
Si	Cvičení – Izotermy 2D modelu látky	1:10	Úvodní slovo k cvičení Laboratorní deník k vyplnění
S3	Cvičení – 2D Clausiova–Clapeyronova rovnice	1:10	Úvodní slovo k cvičení Laboratorní deník k vyplnění
S4	Cvičení – zonální tavba NaCl	1:10	Bod tání NaCl
S5	Cvičení – struktura vody okolo rozpuštěnce	1:10	Struktura vody kolem kulatého rozpuštěnce
SX	Úvod do linuxu	1:10
S0	Shrnutí technických informací pro simulační úlohy v MACSIMUSu	1:10
D1	Databáze a odhadové metody (Michal Fulem)

[ zpět na: bakaláři – magistři ] [ lokální menu: bakaláři – magistři ]