prezentace | pro tisk (8:1) | Videa přednášek | Domácí úkol |
Populární úvod |
simul00.10.pdf |
Populární úvod 45:47
|
Statistická termodynamika |
simul01.10.pdf |
Statistická termodynamika 42:19
|
Modely, silové pole |
simul02.10.pdf |
Silové pole 38:45
Mřížkové modely 11:44
DÚ př. 2: vibrace molekuly vody 6.57
|
[1] Vypočtený příklad 4 (tepelná vlnová délka) odevzdejte do 14.04.2022 |
Molekulární dynamika; Verlet, základy mechaniky |
simul03.10.pdf |
MD I 28:43
MD II 13:16
|
|
Gearovy metody, termostaty v MD |
simul04.10.pdf |
MD: srovnání metod, termostaty 28:44
|
Vyzkoušejte si zachování energie a termostaty dle zadání a přednášky. Nemusíte nic odevzdávat, ale získané znalosti se vám budou hodit u zkoušky! |
Monte Carlo, náhodná čísla |
simul05.10.pdf |
MC: integrace, Metropolis 38:08
náhodná čísla 16:37
|
[2] Vypočtený příklad 6 odevzdejte do 02.05.2022 |
Metodika simulace, chyby |
simul06.10.pdf |
Metodika simulace, chyby 47:59
|
Měření termodynamických veličin |
simul07.10.pdf |
Mechanické veličiny 22:18
Entropické veličiny 46:38
|
Strukturní veličiny |
simul08.10.pdf |
Radiální distribuční funkce 27:25
Pokus: difrakce pomocí laserového ukazovátka 1:05
Strukturní faktor 16:38
|
[3] Vyberte si jeden ze tří úkolů, odevzdejte do 17.05.2022:
Buffonova jehla (aspoň 1000 hodů)
B2 LJ diatomiku (těžší příklad)
MC dusíku v gravitačním poli |
Velikost systému, dosah potenciálu, Coulombovy síly |
simul09.10.pdf |
Dosah potenciálu, cutoff, korekce, Ewaldova sumace 16:38 |
Další soubory – MC |
simul10.10.pdf |
Fluktuace počtu částic, kompresibilita 16:45
Různé soubory; MC: NPT, μVT, reakční, Gibbsův 27:10 |
Další soubory – MD; Nosé-Hoover |
simul11.10.pdf |
NPT soubor v MD, Nosé–Hoover podruhé 11:10
|
ZRUŠENO: [4] Vypočtený příklad 10 odevzdejte do 22.05.2022 |
Neboltzmannovské vzorkování, dynamika s vazbami, optimalizace |
simul12.10.pdf |
Metropolis–Hastings, MC molekul 31:40
SHAKE, optimalizace 24:47
|
Brownovská dynamika a DPD, kinetické veličiny, EMD vs. NEMD |
simul13.10.pdf |
Transportní jevy, Langevin, DPD 27:31
Kinetické veličiny v EMD a NEMD 18:23
|