Advanced methods for molecular dynamics (AP403005)
The course is in English or Czech, according to the audience.
Teaching
- RNDr. Mgr. Jan Heyda, PhD.: Kirkwood–Buff theory, polymers, metadynamics etc.
- prof. RNDr. Jiří Kolafa, CSc.
Basic info
Přednášky
| # | prezentace | for print (10:1) | Videa přednášek | Domácí úkol |
|---|
1
Č |
Brownovská dynamika a DPD, kinetické veličiny, EMD vs. NEMD |
simul13x.10.pdf |
Transportní jevy, Langevin, DPD (48:39)
Kinetické veličiny v EMD (teorie lineární odezvy, Green–Kubo) a NEMD (54:53)
|
1
E |
Brownian dynamics and DPD, kinetic quantities, EMD vs. NEMD |
simen13x.10.pdf |
|
| 2 |
Quantities |
simen07x.10.pdf |
Entropic quantities (metadynamics, histogram reweighting) (52:41)
|
| 3 |
Advanced MC |
simen10.10.pdf |
Fluctuations, finite-size effects (20:58)
MC in various ensembles (35:03)
|
| 4 |
Hastings MC (slides 1–4) |
simen12.10.pdf |
Hastings algorithm, force-bias, preferential sampling (13:23)
|
[ zpět na: bakaláři – magistři ]
[ lokální menu: bakaláři – magistři ]